برنامه تحصیلی مدیریت بازرگانی بر اهمیت ساختار سازمانی و سیاست های مدیریتی در محیط شرکت های مختلف تاکید دارد. گاهی اوقات به عناوین و موضوعاتی مانند بازاریابی، مدیریت منابع انسانی، حسابداری و بازسازی ساختار شرکتی نیز پرداخته می شود.

ساکنان سودان جنوبی باید این گزینه به دنبال آموزش عالی در هر دو یک دانشگاه یا یک مدرسه حرفه ای. هر چند که کمبود هر دو نهاد وجود دارد، چندین برنامه در محل به گسترش چشم انداز فعلی آموزش عالی در سودان جنوبی هستند.

برنامه کارشناسی ارشد یک درجه تحصیلی متمرکز است که اخذ آن مستلزم دو سال کار درسی، تحقیق و پژوهش و احتمالاً ارائه رساله است. این برنامه تحصیلات تکمیلی به دانشجویان امکان می دهد تا در حوزه ای که مورد علاقه آنان است، تحصیلات خود را به شکلی تخصصی تر دنبال کنند.